少年刑務所においては，少年受刑者のほかに26歳未満の青年受刑者をも収容して適正な処遇集団を編成し，職業訓練，教科教育及び生活指導に重点を置いて処遇に当たっており，その実施に際しては，地域社会の人々からも多くの協力を受けている。
　職業訓練の種目は，溶接科，自動車整備科，電気工事科，理容科，ボイラー運転科など多種にわたっており，多くの者が，公認の資格・免許を取得し，又は職業的技能を習得して，出所後の自立更生に役立てている。
　教科教育について見ると，松本少年刑務所では，昭和30年から所内に地元公立中学校の分校を設け，全国の義務教育未修了者のうち適格者を集めて入学させている。平成3年3月には，8人の修了者に対し，例年どおり，本校の中学校長から卒業証書が授与された。また，松本，奈良及び盛岡の各少年刑務所では，地元県立高校の協力を得て高校通信制課程を受講させており，3年3月には計11人が卒業証書を授与されている。このほか，希望者には，社会通信教育及び学校通信教育も受講させている。
　生活指導については，健全な精神を培い，自律心及び遵法精神をかん養し，必要な知識及び生活態度を身につけることを目的として，青年期の特性を十分に考慮しながら，入所時教育や出所時教育，進路指導，読書指導，集会，施設外教育，体育活動などを計画的に実施している。